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简述信息一览:

CRISPR/Cas9实验实操专题一:sgRNA设计

1、CRISPRCas9的原理如下: RNA复合物的形成: CRISPRCas9系统首先通过crRNA与tracrRNA的碱基配对结合,形成tracrRNA/crRNA复合物。 引导Cas9蛋白进行DNA剪切: 此复合物具有引导作用,能够引导核酸酶Cas9蛋白在与crRNA配对的序列靶位点处剪切双链DNA。

2、CRISPR/Cas9技术的成功关键在于sgRNA的设计。通过合理设计sgRNA,可以极大地减少非特异性剪切,提高编辑的准确性。科研人员可以通过基因工程改良Cas9,使其对DNA的切割更具特异性,进一步增强了技术的精确性和可靠性。

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(图片来源网络,侵删)

3、CRISPRCas9的原理主要是基于RNA导向的Cas9核酸酶对DNA进行定点切割。具体来说:RNA复合物的形成:CRISPR系统产生的crRNA与tracrRNA通过碱基配对结合,形成tracrRNA/crRNA复合物。这个复合物具有引导功能,能够识别并绑定到特定的DNA序列上。

CRISPR中sgRNA的设计

sgRNA设计原则: 特异性:确保sgRNA高度特异性,避免非特异性编辑。 GC含量平衡:GC含量应维持在4060%之间,以提高杂交效率。 避免多剪切位点:sgRNA在基因组中不应存在多个剪切位点,减少非预期的多基因编辑。 避免重复或高度相似序列:降低非特异性剪切的可能性。

CRISPR中sgRNA的设计需要遵循以下原则:长度与结构:长度为20nt:sgRNA通常是一个20个碱基大小的合成RNA。PAM序列:需要在基因组中寻找PAM序列,其形式为NGG,“N”可以是A、T、C、G中的任意一个。碱基组成:避免4个以上的T结尾:以减少转录过程中的不稳定性。

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sgRNA的设计过程包括NCBI基因信息检索、特定编辑区域选择、同源区识别、转录本序列下载与分析、共外显子识别、sgRNA序列输入至设计网站、评分与脱靶位点分析,最终获得设计好的sgRNA序列,并送至合成公司进行合成。

sgRNA是一个20bp大小的合成RNA,可以与Cas9蛋白结合,因此在设计sgRNA之前,需要在基因组中寻找PAM序列(Protospacer Adjacent Motif),其形式为NGG,“N”可以是A、T、C、G中的任意一个。sgRNA的作用类似于向导,引导Cas 9蛋白在特定序列上进行切割。

只需5步,快速学会CRISPR/Cas9的sgRNA设计

Sgrna在基因编辑中的应用 在CRISPR-Cas9基因编辑系统中,Sgrna扮演着向导的角色。科学家通过设计特定的Sgrna序列,能够引导Cas9蛋白到目标DNA序列的特定位点,从而实现对基因组特定位置的切割和编辑。这一技术的出现,极大地提高了基因编辑的精准度和效率,为基因治疗、遗传疾病研究等提供了强有力的工具。

自那时起,此技术广泛应用于生物学、医学研究领域,如基因表达调控、细胞动物模型构建、癌基因筛选、药物靶点识别以及基因治疗的创新探索。CRISPR/Cas9系统核心由sgRNA(向导RNA)与Cas9蛋白构成。sgRNA根据特定目标位点设计,Cas9蛋白会依据此向导进行定向编辑。编辑过程中,sgRNA和Cas9蛋白不可或缺。

编码基因的靶向基因敲除 利用CRISPR/Cas9复合体识别并切割基因组DNA,产生双链断裂(DSB),引发DNA损伤修复。其中,非同源末端连接(NHEJ)修复会导致目标基因片段的随机缺失或插入,形成移码突变,实现基因敲除。在编码基因的特定外显子两侧设计sgRNA,可实现片段式的基因敲除。

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